Аналната фисура представлява микроскопични разкъсвания в аналния канал, които се простират до чувствителния външен кожен слой. Те обикновено се появяват по време на трудни дефекации и могат да се разпростират от мукокутанната връзка до денталната линия. След образуването на фисурата, дефекацията става по-трудна по две причини. Първо, пациентите подсъзнателно стягат аналния си мускул по време на дефекация, което води до разширяване на фисурата. Второ, страхът от болка кара пациентите да избягват дефекацията, което води до втвърдяване на изпражненията и задълбочаване на фисурата.