При всеки пациент, който се обръща към лекар заради запек, трябва да се направи подробна анамнеза, физически преглед и преглед на използваните лекарства. Дори при пациенти с дълготраен запек и ниска вероятност от органична причина, трябва да се проведат биохимични кръвни тестове, включително тироидни функции, както и анализ на изпражненията.
Най-предпочитаният метод за изследване на дебелото черво при запек е двойноконтрастна бариева клизма. Този метод предоставя информация за дължината и формата на дебелото черво и може да помогне за откриването на аномалии. При по-възрастни пациенти може да се проведе дефекография за оценка на изхождането и функцията на дебелото черво.
Ако има допълнителни симптоми като кървене, анемия, бърза загуба на тегло или внезапна промяна в навиците на изхождане, колоноскопията е първият метод на избор. Ако при изследването не се открие органична патология, може да се извърши радиопак маркерно изследване за оценка на подвижността на дебелото черво.