Кистите на черния дроб, които не пречат на функциите на органа, могат да останат безсимптомни в продължение на години. При уголемяване те могат да се спукат или да притискат съседни органи, причинявайки подуване, чувство за пълнота и болка в дясната горна част на корема.
Паразитните кисти (ехинококоза) могат да причинят повишена температура, кръвохрак и силен сърбеж на кожата. Видът на ехинококозата, причинен от бактерията E. multilocularis, може да има симптоми, подобни на цироза и рак на черния дроб.